В итоге что я сделал и какой результат.
Использованное ПО: AutoGG и XSVF.
Аппаратная часть:
Материнская плата - Trinity;
Программатор - MTX SPI NAND Flasher V1.0;
Глитч - Matrix v3 без кварца.
Последовательность действий после пропайки глитча по совету
Okas43:
1. Вернул родной NAND, включил консоль, убедился, что все в порядке, выключил консоль;
2. С помощью AutoGG считал NAND и с помощью AutoGG прошил обычный XELL RGH 2.0 по совету
SoToR;
3. Припаял Matrix на материнскую плату, распайку делал сразу в соответствии со схемой
RGH 1.2 с зачисткой маски для сигнала PLL. В цепь PLL поставил резистор 9,1 кОм.
4. С помощью XSVF и MTX SPI NAND Flasher V1.0 прошил Matrix на тайминг 96, файл
rgh12_beta_96_tr.xsvf (чуть ранее я уже определил, что мне подходят тайминги с 88 по 116);
5. Подключил материнскую плату по HDMI к монитору, включил, глитч помигал и, почти мгновенно, начал грузиться XELL.
Далее все по инструкции
https://www.pspx.ru/forum/showthread.php?t=107878
ИТОГ - заметить разницу в скорости загрузки в сравнении с не прошитой консолью я смог бы, наверно, только если поставить их рядом и одновременно включить.
Всем спасибо за советы!
По поводу распайки - сигнал CLK припаял
не на свободную контактную площадку, как на многих фото, а к обкладке резистора. По опыту, при случайном воздействии на провод, так меньше вероятность оторвать контактную площадку.