Испытал программку VPKTool, заметил одну интересную особенность, архив она распаковывает (точнее пару папочек) в папку TEMP того диска где лежит инстал, после чего упаковывает его обратно, у меня к примеру есть привычка в этой папочке хранить весь мусор накачаный с интренетов, так вот, он не вычищая папочку начал весь этот мусор упаковывать в архив.
В общем будьте внимательны, быть может кому-то пригодиться.