Запускаете игру на двоих. Включаете второй геймпад. Появится возможность выбора учётной записи. Выбираете учётную запись, отличную от той из которой запустили игру. Геймпад должен определиться как другой номер.
Если не получается, то у вас действительно проблемы с геймпадом.
А так, как у вас у меня геймпады на ПС4 работают. Но только в меню. Если запустить Нак 2, то можно провести операции выше. Помню, что в ПС3 запускал второго игрока аналогично.