Изначально пользовался встроенным апдейтером, может что то криво скачалось. Сейчас удалил старую версию и установил последнюю скачанную в ручную, всё заработало.
Update:Сейчас для интереса снова установил 3.1.3, затем согласился на обновление до 3.5.5, такая я же ситуация.