cosmik, Если обновиться на новую прошивку то jailbreak слетает автоматом. Следовательно Cydia будет нерабочей или вовсе исчезнет.
Есть репозитории где выкладывается взломанный платный софт. к примеру iguides.ru, можно поискать там, или тут
http://cydia.xsellize.com тоже много чего но буржуйский.
В репозитории
http://apt.iguides.ru/Login-pass/ существуют программы для бэкапа.
К примеру BackToDeb - сохраняет ввиде deb все пакеты с Cydia
К примеру Chronus - вроде как весь iPad бэкапит (не проверял)