COOLERbyPSP, получается ты ставил джейл не на чистую систему. Да думаю ничего страшного в этом нет, прошивка то от этого одна и та же.
Единственное, почему рекомендуют ставить через iTunes, так это при установке она где-то там бэкап оставляет. Потом говорят можно с этого бэкапа восстанавливать прошивку или даже если обновишься на более высшую, то там через
какой-то SHSH типа можно сделать откат.