Я тоже столкнулся с этой проблемой. Даже когда установил винт на 160 гб, 10 гб так и остались за линуксом, который я не устанавливал на новый винт. И самое интересное, при переходе другую OS, стартует линукс, который я не устанавливал на новый HDD. Вот такие дела. Вывод может быть только один, загрузочная часть линукса, записывается на флеш память PS3.