После запуска установщика, во flash0 записываются одни и теже файлы кастомпроши. Это файлы, не имеющие ничего общего с файлами официальной прошивки.
Можно хоть сотню раз запускать установщик и перезаписывать файлы, просто перезаписываются одни и те же файлы, независимо от версии CFWEnabler.