Если битые сектора, то нужно взять найти небитые аналогичные файлы Flash0 и записать их туда обычным способом (скопировать логически). Так как при установке физическим способом, файлы пишутся в битый сектор, не обходя его, а прямо поверх. Тем самым какой-то файл, скорее config.se, получается наполовину битым.